FAQ: Metagenome

7 hechos sobre el estudio del genoma total de bacterias

El genoma total de una comunidad de organismos llamó metagenome. Por ejemplo, allí metagenom bacterias que viven en la boca humana. De hecho, no es muy exacto, porque en las placas dentales viven una comunidad, la lengua encima de las otras vidas, del fondo - el tercer etcétera. Se sospechó que las comunidades bacterianas son muy diversas, pero allí no fue nada bueno la manera de describir esta diversidad.

1. Una de las sorpresas principales, cuando los métodos de análisis identificando la secuencia genética, era sólo cómo gran variedad. Son cientos de genomas, sobre la mayoría del que antes no sabía nada. No se cultivan, es decir no los podemos estudiar por agentes microbiológicos clásicos, y la única cosa que podemos hacer con ellos - es estudiar y comparar sus secuencias genomic.

2. En el hombre, las células bacterianas son al menos 10 veces más grandes que su propia célula. Desde el punto de vista de las bacterias nosotros simplemente gran andar a casa. Claramente la célula bacteriana es considerablemente más pequeña que células humanas, pero, sin embargo, 1-2 kilos de bacterias llevamos.

3. Hombre - este organismo simbiótico, porque somos de bacterias que viven en nosotros, es muy dependiente. Por ejemplo, se relacionan con nuestro sistema inmunológico. Muchas enfermedades autoinmunes, enfermedad intestinal particularmente autoinmune, son una consecuencia de la pobreza flora bacteriana: el sistema inmunológico comienza a correr seco. Hasta cierto punto, nuestras bacterias protege contra patógenos: si tiene una comunidad bacteriana sana, y tiene en las bacterias patógenas intestinas, no serán capaces de penetrar en esta comunidad. Además, metabolismo ocurrimos con estas bacterias. Las vitaminas producen la flora intestinal para nosotros: conseguimos un poco de su comida y hacemos una fracción significativa de nuestras bacterias intestinales. La inyección de Cyanocobalamin - es esencial para la síntesis del ADN.

Hay varios proyectos internacionales para el estudio y la comparación de partes del diferente microbiome humano. Puede describir su diversidad, y podemos tratar de describir las propiedades funcionales del microbiome en general. La gente diferente tiene microbiome individual. Se sabe que la gente obesa y la estructura magra de tipos diferentes de bacterias que viven en el intestino. Esto se puede investigar experimentalmente: toma varios perritos estériles, algunas bacterias infectan un otro - el otro, y aun si los perritos de la misma basura, unos pesarán en las decenas del por ciento más que otros para la misma alimentación.

4. Desde un punto de vista médico, un impacto muy significativo de antibióticos porque los antibióticos - son lo que mata bacterias. Mátele quieren el patógeno, pero usted Grass y su propia flora bacteriana. Allí no son muy apetitosos, pero un procedimiento razonable, cuando una persona antes de darle dosis grandes de los antibióticos, colecciona muestras del taburete y luego restaurar la microflora intestinal, estas muestras se inoculan atrás sus intestinos.

Hay completamente un grupo grande de bacterias, los llamados oportunistas, que siempre están presentes y normalmente ningún efecto en una persona no tiene, y el debilitamiento del cuerpo con dosis altas de antibióticos, cambiando la microflora o tiene problemas con la inmunidad, comienzan a causar la enfermedad.

Un ejemplo típico - es el Estafilococo aureus, está presente en la piel de mitad de la gente, y la erisipela en esto todavía no pasa en absoluto. La mayor parte de estas bacterias no se cultivan.

5. Hay trabajos hermosos metagenomic el análisis de los océanos del mundo. Craig Venter - uno de los autores de los primeros artículos sobre el genoma humano y su siguiente proyecto grande era sólo un análisis metagenomic del océano. Compró un barco y navegó de la Terranova a través del Istmo de Panamá en el Océano Pacífico, y por el camino recogió la muestra acuática y luego determina la secuencia los genomas de bacterias que viven en estas muestras. De las bacterias que habitan los océanos del mundo, sabemos completamente un poco, y esto es una parte grande en la producción de oxígeno, comparado con bosques, que somos tan activamente defienden. El bulto de oxígeno hace la cyanobacteria unicelular en el océano.

6. Hay ejemplos exóticos y muy hermosos de especies de estudio pobres microbiome asociados con condiciones extrañas. Por ejemplo, hay una antigua mina de hierro con el agua ácida, de hecho se diluye ácido sulfúrico. Hay varios tipos de bacterias vivas. Por lo general cuando hace metagenomics, luego reconstruye genomas completos no puede: ha obtenido piezas. Y cuando pocas especies, y leen con muchas piezas, entonces comienzan a mantenerse unidos en genomas completos. Allí está disponible ya un híbrido de clásico microbiológico y enfoques de metagenomic.

7. También había una maravillosa historia sobre un gusano Olavius algarvensis marítimo, que no tiene un estómago. En cambio, tiene unos cuantos piel viva en bacterias de la simbiosis. Otra vez ordenamos de repente y describimos la relación metabólica entre estas especies: algún gusano de aminoácidos hace alguien le ayuda suministrando substrates para la respiración. Del gusano también necesitan bacterias para avanzar lentamente esto, ya que ellos mismos no pueden viajar sobre distancias largas. Resulta tras un tranvía que se mueve a donde la concentración deseada de azufre, hierro y dióxido de carbono. Individualmente, todas estas criaturas para ponerse imposible: sólo pueden existir como una entidad sola. Esto es una tan maravillosa historia metagenomic.