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Genoma mínimo

17 Nov 2016

El Bioinformatics el Dr. Doping cuenta sobre los genes del ancestro común, apagando los genes de bacterias de Escherichia coli y concurso.

¿Qué son los enfoques diferentes a la definición del genoma mínimo? ¿Como métodos de investigación de genes experimentales puestos en práctica que se requieren?

Hay varios enfoques a la definición de lo que es el genoma mínimo. Primero - es evolutivo. Está basado en la filosofía natural que si cierto gene está presente en todos los organismos, probablemente no puede hacer sin este gene. Aquí hay realmente un engaño. Como cuando digo que el mismo gene está presente en varios organismos, la pregunta se levanta, y cómo hacen sé que esto es el gene mismo y esto es todo el gene mismo, cuando está en tres genomas diferentes. La definición evolutiva es: creemos que esto es el gene mismo, si tuvieran un ancestro común y la historia de este gene es exactamente la misma clase de la historia, es decir no había copias y los genes diferenciados sólo a consecuencia de speciation.

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Si cultiva bacterias en un medio, la única fuente de carbón que es, por ejemplo, fructose, y ha matado el transportador fructose o ha matado la enzima qué catálisis la primera reacción de la nutrición fructose, todo en su ambiente, excepto fructose, nada y la posibilidad lo rompió. Y si está en la misma glucosa del flujo del ambiente, será maravilloso vivir y prosperar. Así aquí debemos decir que les dejaremos cultivar un ambiente rico en el cual hay todo que podría necesitar y considerar el genoma mínimo tal ambiente. Por tanto la gente hace, y también es la definición razonable. Es más suave que evolutivo. Es decir los genes que son absolutamente universales, evolutivamente bajan que genes que se requieren para tal individuo se apaga.

Los experimentos son ahora genomas mínimos de la mayor parte de carreras por Craig Venter, que se implicó en el genoma humano, y luego cambió a los genomas de bacterias. Aplicado la idea que en hacer por tanto trata de venderse, yo, francamente, no muchísimo. Como tiene esta idea que estamos aquí para hacer un genoma mínimo, y luego añadiremos opcionalmente a él algunas piezas y haremos encargado por las bacterias, «diseño», que necesitamos. Realmente no entiendo por qué tecnológicamente se justifica porque realmente lo podemos hacer ahora. Podemos tomar el E. coli - tenemos un juego de tensiones tecnológicas - y pueden hacer lo mismo. Pero Venter dice que no habrá nada extra. Por otra parte, seguramente no será nada extra, pero al mismo tiempo será completamente de muertos.

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